La temporada 2009-10, en la que el banquillo de la Juventus alterno entre Ciro Ferrara y Alberto Zaccheroni no fue más rentable que la anterior para Giovinco, esto debido a las lesiones y a las exclusiones por elección técnica, sólo logró anotar un gol y dos asistencias en un total de 19 partidos. Tras terminar el préstamo al Empoli regresó a la Juventus junto con Marchisio. En el Empoli se ganó rápidamente la titularidad y jugó 35 partidos marcando 6 goles y realizando 4 asistencias.
