Ya retirado, entre los años 2008 y 2010, Peruzzi formó parte del equipo de la selección italiana como colaborador del entrenador Marcello Lippi. El 22 de octubre de 2010 fue nombrado segundo entrenador de la selección de fútbol sub-21 de Italia, dentro del equipo técnico liderado por Ciro Ferrara. Tras dicha competición, equipacion juventus se retiró de la selección habiendo jugado 31 partidos. Es una lástima que no haya podido jugar un mundial como titular y creo que lo merecía.
