En marzo, el técnico serbio fue cesado y Amorrortu volvió a hacerse cargo del equipo, que cosechó la peor clasificación de su historia en liga hasta ese momento, acabando en 15.º posición. En la misma temporada el equipo jugó en la Copa Intertoto sin obtener buenos resultados, luego llegaron sucesivamente los entrenadores Roy Hodgson y Giampiero Ventura, pero en 2002 volvió a la posición de entrenador Spalleti.
